1. Probiotike treba uzimati u toku jela, ali treba paziti da temperatura hrane ne prelazi 40 ˚C kako se probiotik ne bi oštetio
2. Pre upotrebe treba proveriti pravilan način primene, jer danas već postoje direkt oblici koji se uzimaju bez vode ili čokoladice koje treba sažvakati
3. Kada se uzimaju zajedno sa antibioticima treba napraviti vremenski razmak od tri sata, ovo pravilo ne važi za proizvode na bazi Boulardii-a
4. Za optimalno delovanje kod dijareje treba nastaviti primenu 5-7 dana nakon nestanka svih simptoma, a u slučaju antibiotske terapije preporučljiva je primena 7-10 dana nakon poslednje doze antibiotika